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故事讲述的是就读凤城学园的15岁少女泉水子，自少便在熊野古道的玉仓神社之中长大。
泉水子是名颇害羞的少女，而且所有给她触碰到的电子产品也必定损坏。
当她想到想离开这熊野古道并往城巿里居住的时候，她的监护人雪政却建议她往东京的鳯城学园就读，并逼他的儿子深行与泉水子同行，以便照顾她。起初，泉水子 与深行也互相讨厌大家，但当一件怪异的事件发生在今年以“战国时代”为主题的学园祭上，他们的关系便产生变化。
在这事件中，泉水子得知她是姬神的最后一名 依代，而深行则是泉水子的山伏守护者。作为姬神的最后一名依代，作为濒临灭绝的姬神依代，泉水子与深行将展开改变世界的事件。
《RDG濒危物种少女（RDG レッドデータガール）》是由被称为勾玉三部作(《破天神记》三部曲的《空色勾玉》、《白鸟异传》以及《薄红天女》）的日本小说家荻原规子原作、酒井驹子负责插画、角川银匙系列和角川文库刊载、以日本神道为主题的系列小说。
2011年12月，在角川文库的宣传网页上宣布“动画化计划进行中”的消息。
在2012年10月26日发售的漫画杂志《月刊少年ACE》上，由负责动画角色原案的岸田メル负责负责角色原案、琴音らんまる负责作画的漫画版开始连载。
人物列表
性别：男
属性：
简介：相乐深行
声优:内山昂辉
泉水子的青梅竹马、同班同学。
成绩优秀、样貌端正，在女生当中很有人气，但是对泉水子的态度却很顽固。
家系是修行僧，本人也在修行中.
很讨厌父亲雪政，喜欢泉水子
性别：女
属性：
简介：宗田真响
声优:米泽圆
就读高中部1年A班，宿舍与泉水子同房的女孩。国中时期三年的成绩为学年第二，在男女生之间皆有人气。真夏的姐姐，但对真夏的感情却不单单是姐姐对弟弟的情感。
性别：女
属性：
简介：宗田真澄
声优：木村良平
与真响、真夏为三人兄弟，年幼时已过世。（实际上是九头蛇的一个头所做的一个迷梦）泉水子的室友宗田真响和她弟弟召唤出的，成绩顶尖的男孩子，因泉水子对他的纯粹的友情而感动，三弟真澄是比一切都更重要的存在，长野县户隐的忍者家系。
性别：女
属性：
简介：姬神
声优：田中理惠
铃原泉水子是其附身的容器。掌握人类存亡的关键存在。当她苏醒在泉水子身上时，泉水子都会失去意识。其实是铃原泉水子本身轮回三世之后，变成了姬神。每轮回一世便凭依在铃原家世代女性身上。这一世的铃原泉水子为第四世。也是最后一世
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