米粒木匠全集动画讲述的是少年米粒冒险的的故事。少年米粒来到古古纳小镇，在小玉与阿凉两姐妹经营的面店落下脚来。顽皮的公主卓悠来到古古纳，却因为吃了面店的食物引发过敏，多亏米粒及时治疗，卓悠对米粒十分赞赏。
